Centre EPIC-IST

L'objectif global de cette application est d'établir un centre de recherche coopérative STI intégré et interdisciplinaire (STI-CRC) idéalement placé pour adopter une approche synergique comblant les lacunes pour

1. comprendre les données épidémiologiques de base sur le fardeau des IST,
2. comprendre l'histoire naturelle des IST et le fardeau de la maladie,
3. faire progresser la recherche scientifique fondamentale pour les vaccins contre les IST, y compris le développement de modèles animaux appropriés, la découverte d'antigènes à haut débit et de nouveaux systèmes d'administration d'antigènes,
4. mener des études de base en milieu clinique pour élargir la base de connaissances globale sur l'immunité des muqueuses dans le tractus génital ; et
5. évaluer l'efficacité de la prévention des IST dans le monde réel et les résultats associés.

Les infections sexuellement transmissibles (IST) représentent une cause majeure de morbidité et de mortalité reproductives chez les femmes, pour un coût annuel des soins de santé estimé aux États-Unis (É.-U.) à 16 milliards de dollars. Sur les 20 millions de nouvelles infections aux États-Unis chaque année, le virus du papillome humain (VPH) et Chlamydia trachomatis (CT) sont de loin les plus courants.

Bien qu'asymptomatiques chez la plupart des femmes, les deux infections peuvent entraîner des effets indésirables graves. L'infection par un ou plusieurs des 14 génotypes de HPV à haut risque est attribuable au développement de presque tous les cancers invasifs du col de l'utérus et de ses lésions précurseurs, la néoplasie intraépithéliale cervicale (CIN). Le traitement par excision des CIN de haut grade chez les jeunes femmes en âge de procréer peut entraîner de graves complications de grossesse, y compris des accouchements prématurés. L'infection par le VPH6/11, attribuable à plus de 90 % des verrues génitales, peut avoir une morbidité physique et des conséquences psychosociales importantes, en particulier dans les populations réfractaires au traitement, et l'infection au scanner peut entraîner des complications graves telles que la maladie inflammatoire pelvienne, la grossesse extra-utérine et l'infertilité tubaire. .

Aux États-Unis, malgré la disponibilité du dépistage et du traitement du VPH et de la TDM et dans le cas du VPH, des vaccins efficaces de première génération, on estime que plus de 39.5 millions de femmes âgées de 14 à 59 ans sont actuellement infectées par le VPH et en 2011, près de 1.5 millions de cas d'infection CT ont été signalés aux Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis. De nouvelles approches sont essentielles pour comprendre le fardeau toujours élevé de ces infections et les obstacles et les succès des interventions de santé publique.

Objectif 1

Élargir la portée du Centre interdisciplinaire de prévention du VPH de l'Université du Nouveau-Mexique (UNM-IHPC) en créant le Centre interdisciplinaire d'épidémiologie et de prévention des infections sexuellement transmissibles (EPIC-STI) en incorporant des approches de recherche transdisciplinaires coopératives pour combler les principales lacunes dans le connaissances requises pour réduire le fardeau des infections sexuellement transmissibles évitables ou traitables, en mettant l'accent sur les co-infections au VPH, au CT et aux IST.

Objectif 2

Pour financer et soutenir 4 projets représentant un éventail de programmes de recherche interdisciplinaires et interactifs, notamment : Le projet 1 élucidera les détails du développement d'une immunité protectrice contre l'infection CT en utilisant des modèles murins et in vitro pour comprendre comment l'immunité à médiation cellulaire CD4+ de longue durée se développe et trafics pour se protéger contre la réinfection de la muqueuse génitale. Le projet 2 utilise de nouvelles stratégies vaccinales basées sur la technologie d'affichage du virus pour générer une large protection contre les infections à HPV et CT dans les stratégies vaccinales simples et combinées. Le projet 3 utilise une approche de conception mixte pour caractériser le fardeau de l'infection et de la co-infection au niveau de la population et la réponse au niveau individuel au sein et entre les femmes hôtes à l'infection CT en utilisant des systèmes de surveillance de dépistage du col de l'utérus basés sur la population et une étude épidémiologique moléculaire prospective de cohorte. étudier le design. Le projet 4 utilise des systèmes d'information axés sur les femmes pour délimiter l'impact sur la population de la vaccination contre le VPH et les modifications apportées aux directives de dépistage du cancer du col de l'utérus sur les infections sexuellement transmissibles et les résultats des maladies associées.

Objectif 3

Établir deux noyaux qui soutiennent l'EPIC-STI et les approches de recherche interdisciplinaire. Noyau A : Noyau administratif pour soutenir la coordination, la communication, l'intégration, la collaboration et la sensibilisation qui assurent la réalisation de tous les objectifs du Centre ; Noyau B : un noyau de biostatistique et de bioinformatique pour soutenir l'analyse des ensembles de données à haute densité générés par les programmes en population et en laboratoire et développer de nouvelles approches analytiques.

Objectif 4

Mettre en œuvre des projets pilotes de recherche développementale (DRP) sous l'approbation du comité exécutif du NIAID STICRC dans le but d'encadrer et d'améliorer les chercheurs nouveaux et juniors en transition vers des carrières de recherche indépendantes en STI

Des groupes d'experts ont été réunis au cours des dernières années par les Centers for Disease Control (CDC) des États-Unis et l'Organisation mondiale de la santé (OMS) avec pour mandat d'identifier les obstacles à la prévention et au contrôle efficaces des infections sexuellement transmissibles (IST) et de leur maladie. séquelles, y compris le développement de vaccins efficaces. Parmi les consensus concernant les lacunes de la recherche figurait la nécessité de :

1. obtenir de meilleures données épidémiologiques de base sur le fardeau des IST,
2. améliorer notre compréhension de l'histoire naturelle des IST et du fardeau de la maladie,
3. faire progresser la recherche scientifique fondamentale pour les vaccins contre les IST, y compris le développement de
4. modèles animaux, découverte d'antigènes à haut débit et nouveaux systèmes d'adjuvant et d'administration, et
5. mener des études fondamentales et translationnelles en milieu clinique humain pour élargir la base de connaissances sur l'immunité des muqueuses dans le tractus génital. L'objectif de cette demande est d'établir un centre interdisciplinaire intégré idéalement placé pour adopter une approche synergique pour combler ces lacunes et d'autres en matière de recherche. Les chercheurs qui composent l'EPIC-STI sont des leaders internationalement reconnus en épidémiologie moléculaire, immunologie et
6. développement de vaccins, avec une expertise particulière en papillomavirus humain (HPV) et Chlamydia trachomatis (CT) infections. L'EPIC-STI étendra le modèle réussi du Centre interdisciplinaire de prévention du VPH de l'Université du Nouveau-Mexique (UNM-IHPC) actuellement financé à la description épidémiologique du fardeau et de l'impact d'autres IST et co-infections courantes, au développement de nouveaux VPH et les vaccins CT utilisant la cartographie d'épitopes à large spectre et l'administration de vaccins via des plateformes de particules de type virus hautement immunogènes (VLP), et l'évaluation de la réponse immunitaire aux infections CT utilisant des études complémentaires sur l'homme et la souris.

Les 4 projets et 2 noyaux financés par l'EPIC-STI représentent un programme de recherche hautement intégré conçu pour accélérer la recherche translationnelle afin d'améliorer la prévention et le contrôle des principales IST et des séquelles de maladies associées.

Les projets EPIC-STI 1 et 3 utiliseront des approches complémentaires pour combler les lacunes critiques dans les connaissances nécessaires pour améliorer notre compréhension du développement de la réponse immunitaire protectrice de l'hôte à l'infection CT. L'un des objectifs de ces projets synergiques sera d'améliorer la compréhension de la réponse immunitaire au niveau de la muqueuse génitale, y compris la caractérisation du suivi des lymphocytes T mémoire jusqu'à la muqueuse et la façon dont le microenvironnement immunologique de la muqueuse interagit pour affecter le trafic ou le fonctionnement des réponses des lymphocytes T à la tomodensitométrie. infection à l'aide de modèles murins.

Le projet 3 fournit une caractérisation détaillée et étendue du microenvironnement immunitaire soluble dans les infections CT humaines et détermine si les profils immunologiques spécifiques changent après un traitement antibiotique et sont en corrélation avec la résolution spontanée de l'infection par rapport à la susceptibilité à la réinfection. La traduction des résultats des études humaines du projet 3 en études animales du projet 1 sert à accélérer et à affiner le modèle murin d'infection et d'immunité à CT. Un élément central de ces deux projets est de développer une meilleure compréhension du caractère et de la variabilité des réponses immunitaires normales afin d'identifier les écarts qui résultent d'une infection ou qui peuvent être associés à la protection.

Traditionnellement, les vaccins reposaient sur une stratégie : imiter le plus fidèlement possible les conséquences immunologiques d'une infection naturelle. Le projet 2 de l'EPIC-STI utilisera un nouveau système d'affichage de particules de type virus bactériophage (VLP) qui peut être utilisé à la fois pour l'identification et la mise en œuvre d'un vaccin. Nous avons déjà utilisé cette plate-forme pour développer un vaccin contre le VPH de nouvelle génération, et l'un des objectifs du projet 2 est de formuler ce vaccin pour remédier aux disparités américaines et mondiales en matière d'accessibilité et d'accessibilité des vaccins dans les populations rurales/éloignées.

Cette plate-forme VLP hautement immunogène sera également utilisée dans les composantes CT de ce projet. Les candidats vaccins CT seront identifiés à l'aide d'une découverte d'antigènes à haut débit et sensible qui utilise des sérums issus des projets 1 et 3 en parallèle avec des stratégies bioinformatiques complémentaires. Les synergies seront renforcées par la mise à l'essai de candidats vaccins principaux à l'aide du modèle d'infection CT de pointe du Dr Starnbach.

leader: Michael Starnbach, Ph.D.

Équipe:
Jennifer Helble 
Rebecca Lijek, PhD
Meghan Parret

Collaborateurs passés :
Sergio Dávila
Madeleine Haff
Xuquing Zhang. Doctorat

leader: Bryce Chackerian, Ph.D.

Équipe:
Susan Noyau
Kathryn Frietze, Ph.D.
Naomi Lee, Ph.D.
Julianne Peabody
David Peabody, Ph.D.

Collaborateurs passés :
Pavan Mutiltil, PhD

leader: Alberta Kong, MD

Équipe:
Mary Burns, AP-C
Derrell Dinwiddie, Ph.D.
Elizabeth Jiménez, PhD, RD
Franceska Kelly
Donna Sedillo, MS
Monique Vallabhan, DNP, FNP-BC, MSN, IA

leader: Cosette Wheeler, Ph.D.

Équipe:
Norah Torrez Martinez 
Salina Torres, Ph.D.
Emily Merchasin, MS
Julie Bard, MS

Élèves:
Mankirt "Nikki" Grewal (U)
Chandra Henry (U)
Robyn Johnson (U)
Danyelle Wesselkamper (G, PharmD)

Collaborateurs passés :
Florence Asbury
Christian Ballestéros
Patrick De Bonis
Susan Eaton
MaryAnn Jaramillo-Chavez
caro morris

Le noyau administratif du Centre interdisciplinaire d'épidémiologie et de prévention des infections sexuellement transmissibles (EPIC-STI) fournira une infrastructure et des activités de soutien aux projets scientifiques, au noyau de biostatistique et de bioinformatique et aux projets pilotes de recherche développementale (DRP) sous la supervision du directeur du programme EPICSTI. . Une activité centrale de l'EPIC-STI sera de coordonner les examens de ses DRP par l'intermédiaire du comité exécutif du NIAID STI-Cooperative Research Center (CRC). Les recommandations du comité seront mises en œuvre pour soutenir les objectifs scientifiques des DRP et aligner les stratégies de mentorat pour combler avec succès les écarts entre l'établissement précoce d'un nouveau chercheur dans les carrières des IST. L'administration EPIC-STI fournira également une infrastructure au sein du Centre des sciences de la santé de l'UNM (UNM-HSC) qui améliore les interactions au sein du programme et de ses collaborateurs et qui soutient et optimise la réalisation des objectifs interdisciplinaires du Centre.

Les buts et objectifs de l'administration de l'EPIC-STI sont de :

1. Coordonner les activités liées au développement du Centre
2. Superviser le développement et la mise en œuvre continus du programme de mentorat DRP et de ses projets scientifiques associés
3. Gérer les ressources fiscales du Centre et communiquer avec le programme NIAID
4. Tenir des dossiers, surveiller et mettre à jour les données de conformité liées aux projets et aux cœurs
5. Coordonner les réunions entre les enquêteurs de l'UNM, de Harvard, du Wolfson Institute of Preventive Medicine et avec les membres du conseil consultatif externe, les conférenciers et le NIAID
6. Gérer et planifier les déplacements et les échanges de réactifs externes et les communications pour le Centre
7. Fournir un soutien pour les rapports de renouvellement non compétitifs, y compris la production d'un rapport d'étape annuel
8. Gérer les demandes d'utilisation des ressources partagées développées par l'EPIC-STI
9. Interface avec toutes les activités du centre pour mettre à jour le contenu du site EPIC-STI

Le noyau de biostatistique et de bioinformatique (BBC) fournit un soutien à la conception, à la gestion des données et à l'analyse des études de recherche pour le Centre interdisciplinaire de prévention de l'épidémiologie des infections sexuellement transmissibles (EPIC-STI). De plus, il sert de ressource centralisée pour le conseil biostatistique, le développement de méthodes et les analyses pour les projets scientifiques. L'unité fournit une base analytique centralisée à chacun des quatre projets scientifiques ainsi que de nouveaux projets pilotes de recherche développementale à tous les niveaux d'investigation, en commençant par la formulation d'hypothèses plus spécifiques liées aux hypothèses unificatrices globales, en examinant les plans d'étude et en évaluant les utilité des techniques de mesure. L'accompagnement et la consultation se terminent par une aide à l'interprétation, à la présentation et à la rédaction finale des résultats. L'EPIC-STI BBC sert également à stocker et à maintenir une ressource de données de santé publique basée sur la population, le New Mexico HPV Pap Registry (NMHPVPR), une pierre angulaire de l'EPIC-STI global et un modèle d'informatique de santé intégrée.

La BBC va promouvoir les objectifs de recherche EPIC-STI comme suit :

1. finaliser les conceptions et les protocoles de l'étude en collaboration avec chaque chercheur de l'étude
2. mentorer, former et favoriser des programmes d'échange pour les chercheurs débutants en transition vers des carrières dans la recherche en STI
3. collaborer avec les chercheurs de l'étude au développement d'instruments et d'applications de collecte de données
4. aider au développement de protocoles pour la transmission sécurisée des données
5. collaborer avec les chercheurs de l'étude à l'élaboration de manuels d'étude détaillés
6. développer et gérer les bases de données relationnelles centrales et spécifiques au projet EPIC-STI, y compris le NMHPVPR
7. exécuter les vérifications du programme de contrôle qualité SAS
8. maintenir une base de données principale pour chaque projet avec des sauvegardes et des contrôles de sécurité appropriés
9. suivre l'avancement de l'étude et diffuser des rapports trimestriels
10. produire des rapports résumant l'acquisition de données par sujet, les distributions et les statistiques récapitulatives pour les variables primaires
11. interfacer et établir des liens avec le système d'information sur la vaccination à l'échelle de l'État du Nouveau-Mexique (NM-SIIS) et d'autres sources de données administratives et statistiques
12. effectuer des analyses statistiques de base, complexes et exploratoires
13. développer de nouvelles méthodes d'analyse d'ensembles de données complexes
14. développer et maintenir le site web et les portails de l'EPIC-STI.